Opakující se a funkční regulační mutace u rakoviny prsu
Genomická analýza nádorů vedla k identifikaci stovek rakovinných genů na základě přítomnosti mutací v oblastech kódujících proteiny. Na rozdíl od toho je mnohem méně známo o mutacích způsobujících rakovinu, které se vyskytují v nekódujících oblastech. Autoři provedli sekvenování v 360 vzorcích primární rakoviny prsu a vyvíjejí výpočetní metody k identifikaci významně mutovaných promotorů. Jasné signály se vyskytují v promotorech tří genů. Jedním z nich je gen FOXA1, který nese v promotoru mutační hotspot, což vede k nadměrné expresi prostřednictvím zvýšené vazby na E2F. RMRP a NEAT1 jsou dva nekódující RNA geny, které nesou mutace ovlivňující vazbu proteinů na promotory a narušující hladiny exprese. Studie ukazuje, že promotorové oblasti obsahují recidivující mutace s funkčními následky a že mutace se vyskytují s podobnými frekvencemi jako v kódujících oblastech.
Recurrent and functional regulatory mutations in breast cancer
