Dostupnost aminokyselin ovlivňuje přítomnost bakterie Acinetobacter baumannii ve střevech
Asymptomatická kolonizace je důležitá pro perzistenci patogenů rezistentních na antibiotika, jako je například bakterie Acinetobacter baumannii. Přítomnost těchto bakterií může vést k akutní infekci. V této studii autoři zjišťovali ekologické faktory, které ovlivňují kolonizaci střeva A. baumannii. Podařilo se jim na myším modelu prokázat, že A. baumannii se vyvinula tak, aby využívala aminokyselinu ornitin jako nepřednostní zdroj uhlíku. A. baumannii kóduje ornitin sukcinyl transferázu nezbytnou pro katabolismus ornitinu. Ornitin tyto bakterie využívají hlavně v podmínkách zvýšené mikrobiální diverzity, kdy ostatní bakterie využívají jiné typy aminokyselin. Ornitin dodaný stravou podporuje dlouhodobé vylučování A. baumannii stolicí. Naproti tomu doplnění preferovaných zdrojů uhlíku, tj. dostatečné množství glutamátu sodného nebo histidinu, ruší potřebu katabolizovat ornitin. Výsledky také ukazují, že výskyt A. baumannii ve střevech je vyšší u kojenců krmených umělou výživou, což je samozřejmě dáno složením formule vs. mateřské mléko. Výsledky ukazují, že možnost katabolizovat ornitin, který nevyužívají další bakterie, usnadňuje kolonizaci střeva A. baumannii a poskytuje rezervoár pro šíření patogenů.
https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(25)00275-6
Obnova mikrobiomu lidské kůže po zotavení imunitního systému po transplantaci hematopoetických kmenových buněk
Mikrobiom lidské pokožky je propojen s hostitelskou imunitou. Většina studií zkoumala vliv mikrobiomu na imunitní systém, v této studii se autoři zaměřili na opačný efekt, tj. vliv imunitního systému na složení mikrobiomu. Byl zkoumán vliv narušení imunitního systému a transplantace hematopoetických kmenových buněk (HSCT) na mikrobiom kůže. Ve studii bylo 24 pacientů s vrozeným deficitem DOCK8 (dedicator of cytokinesis 8). Při analýze 590 metagenomických a 534 16S rDNA sekvenačních vzorků mikrobiomu kůže odebraných z osmi různých kožních míst před HSCT bylo odhaleno narušení kožní mikrobioty (medián eukaryotických virů 67,6 % vs. 0,04 % v kontrolní skupině) s extrémní diverzitou lidských papilomavirů a polyomavirů, včetně onkogenních virů. Po HSCT došlo ke změnám mikrobiomu, snížilo se zastoupení Staphylococcus aureus. Počty DNA eukaryotických virů dramaticky poklesly (z 79,7 % ± 28,3 % na 4,9 % ± 8,6 %) 12 měsíců po HSCT. Obnovené mikrobiální komunity zůstaly relativně stabilní během 1 roku sledování s vymizením onkogenního HPV a bez konvergence s dárci transplantátů. Tyto výsledky dokládají důležitost imunitního systému při obnově kožního mikrobiomu.
https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(25)00274-4
